Manuaalinen laatikkokokoonpano ei tue vain ei--standardinomaisten-muotoisten rakenteiden tuotantoa, vaan se on myös optimaalinen valinta monimutkaisten ei--standardien muotojen toteuttamiseen.
Koneen kokoonpano perustuu standardoituihin muotteihin ja voi tuottaa vain tavallisia neliön tai suorakaiteen muotoisia laatikoita sekä pieniä määriä esiasetettuja erikoismuotoisia malleja. Sitä vastoin manuaalisella kokoonpanolla voidaan toteuttaa tarkasti monimutkaisia rakenteita, kuten epäsäännöllisiä monikulmaisia laatikoita, monikerroksisia sisäkkäisiä sisälokeroita, viistoliitoksilla varustettuja laatikoita, kolmiulotteisia onttoja-suunnittelulaatikoita ja laatikoita, joissa on erikoiskiinnikkeet tai integroidut kahvat.
Erikoismuotoisten-laatikoiden valmistaminen koneella vaatii räätälöityjä-muotteja, mikä aiheuttaa korkeita kustannuksia ja pitkittyneen tuotantosyklin - tämä menetelmä on taloudellisesti kannattava vain massatuotantotilauksissa. Manuaalinen kokoonpano ei edellytä muottien valmistusta: valmistele paperiosat stanssaus- suunnittelusuunnitelman mukaan, ja sen jälkeen tuotanto voidaan aloittaa välittömästi.
Manuaalisen asennuksen aikana työntekijät voivat tarkistaa ja säätää kunkin yksittäisen osan asentoa. Esimerkiksi liimattaessa laatikoita, joissa on kolmiulotteisia kosketuskuvioita, painetta voidaan säätää kuvion muodonmuutosten estämiseksi. Kun osia liitetään kultafoliomeistamalla, liitokset kohdistetaan erittäin tarkasti, jotta ylimääräinen liima ei peitä leimattuja alueita, mikä säilyttää kaikkien käsittelyvaiheiden vaikutuksen tinkimättä.
Koneen kokoonpano ei aina sovellu erittäin jäykkien tai hauraiden materiaalien, kuten erikoispaperin, paksun pahvin ja aaltopahvin komposiittimateriaalien, käsittelyyn: osien kuljetuksen aikana vallitseva korkea paine aiheuttaa usein materiaalien taipumista tai halkeilua. Manuaalisessa kokoonpanossa käytetään vaiheittaista--askel alhaista-paineliimausmenetelmää: työntekijät mukauttavat toimintatekniikoitaan materiaalin sitkeyden mukaan. Esimerkiksi särkyvää taidepaperia käsiteltäessä esitaitto tehdään ennen liimaamista, jotta materiaalivauriot vältetään kokonaan.